原屬於強制猥褻罪，後因修法改為強制性交罪

甲對15歲的少女A以手指侵入其下體，案經檢察官偵查，原來認為是屬於強制猥褻的範圍，後來因為在偵查中法律對於該行為修法，納入到強制性交罪之範圍，於是檢察官偵查終結後，以強制性交罪提起公訴。想請問法院對甲犯罪行為的法律適用？若後來審判發甲的行為是A所同意的，又應該為何法律適用？